Mustafa Necmi İlhan 1968 yılında dünyaya gelmiştir. Ankara Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesinden 1995 yılından mezun olduktan sonra aynı üniversitede Yüksek Lisans ve Uzmanlık eğitimini tamamlamıştır. Uzmanlık eğitimini Sağlık Kurumları Yönetimi Bölümünde tamamladıktan sonra 2001 yılında yine aynı üniversitede Halk Sağlığı Anabilim Dalı'nda doktora yapmıştır.